Reconocido por su papel como el torpe y despistado Mr. Bean, el cómico inglés Rowan Atkinson protagoniza las aventuras de un particular agente secreto en una divertida parodia de las películas de acción al estilo James Bond. La bella cantante Natalie Imbruglia y el reconocido y talentoso actor John Malcovich, co-protagonizan el film, donde este particular héroe tratará de evitar que Inglaterra, su madre patria, caiga bajo el poder de un malvado déspota.
Cuando el Servicio Secreto Británico descubre que existe un plan para apoderarse de las Joyas de la Corona, envía al Agente número uno, a resolver el caso. Pero las fuerzas del mal lo liquidan. Desdichadamente casi todos los miembros hábiles de sus filas muy pronto se unen al Agente número uno en el otro mundo.
Ahora, solo queda un hombre para proteger su país, vengar el asesinato de todos los espías del Servicio Secreto y descubrir al villano: Johnny English. No conoce el miedo, ni teme al peligro, porque no sabe nada. No es el mejor que tienen, es el único que queda vivo.